riapri il volano e vedi se c'è qualcosa di strano, un filo che va a massa o altro; il fenomeno da te descritto è quello di una accensione anticipata, le fiamme partono quando i travasi sono ancora aperti in fase di risalita del pistone, e risalgono dal carburatore, Escluderei un ritardo che faccia lo stesso fenomeno col pistone in fase discendente.
Come hai misurato i 0,040 mm di apertura delle puntine?

Occhio ai pericoli di incendio!