Stranissima, mai vista questa centralina!
Mi verrebbe da pensare ad un prototipo... dove hai recuperato quel motore? Intendo: in che zona d'Italia?
Il problema che descrivi potrebbe essere imputabile alla bobina di alimentazione, a me ne capitò una non originale che dava grossi problemi oltre un certo numero di giri, iniziando a strappare.
Tuttavia può anche essere che le caratteristiche della bobinetta siano diverse dallo standard, dovendo lavorare con una diversa accensione.
La cosa strana è che, a quanto riferivi, questo motore era 200 e stava montato sotto ad un preArcobaleno. Quei connettori però si sposerebbero male col preArcobaleno...
Comunque direi che il settore luci, con le quattro bobine in serie, dovrebbe essere quello classico.
Resta da capi se bobinetta e pickup che hai trovati montati funzionerebbero correttamente con la centralina della foto. Se hai voglia di fare qualche esperimento...